Homework 2 : Bioinformatic tool (Clustalx 2.0.11)
การทำ Alignment ของเชื้อ Influenza A virus ที่ได้มาจากผู้ป่วย Hong Kong โดยเปรียบเทียบความเหมือนหรือความแตกต่างของ Sequence ของ NA gene for neuraminidase จาก Specimen ที่ต่างกัน
จัดทำโดย
นางสาวฐานิดา สุวลักษณ์ 5336202 RACP/M
ขั้นตอนการทำ
1. เปิด Website : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
1.1 เลือก Nucleotide
1.2 พิมพ์ “Influenza A virus neuraminidase” แล้วกด Search
2. เลือก Sequence ที่ต้องการ จากนั้นกด Send to File FASTA format Create file
3. เปิดโปรแกรม Clustalx 2.0.11
4. เลือก Load Sequence
5. โปรแกรมจะแสดง Sequence ตามที่ต้องการ
6. เลือก Alignment Do Complete Alignment
7. กด Ok เพื่อ Save file ที่ผ่านการทำ Complete Alignment
 |
8. โปรแกรมจะแสดงผลการทำ Complete Alignment ของ Sequence ทั้ง 3 เส้น ซึ่งพบได้ว่า Sequence ทั้ง 3 เส้นที่ได้มาจาก Specimen ที่ต่างกัน แต่มาจากแหล่งเดียวกัน คือ Hong Kong จะให้ลำดับของ Sequence ที่เหมือนกัน |
ไม่มีความคิดเห็น:
แสดงความคิดเห็น